开发区海关现有人员70人,下设办公室、人教科、通关管理科、查验科、保税审批科、保税核销科、风险监控科、调查科、驻和尚岛办事处等科级分支机构9个及驻北良港办事处副处级机构1个。
自筹建至今,开发区海关不断加强业务建设、队伍建设及基本建设工作。目前,拥有办公楼18,000余平方米,固定资产总值8000余万元。为开展好监管工作打下良好基础。十五年来,开发区海关以自身优良的业务素质和文明高效的服务,即加强了对区内加工贸易的有效监管,又方便了区内企业的合法进出。尤其近年来,不断进行监管业务改革,建立起了以信息技术和风险管理为主的新的加工贸易监管体系,进一步规范了作业程序,强化了监督制约。根据国家政策调整和区内经济形势变化,适时推出有力措施,发挥海关监管的职能作用,依法行政,贯彻政策,有力地推动了区内加工贸易的健康发展,促进了开发区以加工贸易为主的外向型经济的腾飞。为此,多次获得大连关区“基层基础建设先进单位”、“文明窗口标兵单位”等光荣称号。